Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA3Q16787 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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