Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECM1Q16610 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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