Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACKR1Q16570 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACKR1Q16570 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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