Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms