Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMD5Q16401 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms