Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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