Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITSN1Q15811 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITSN1Q15811 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms