Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRADDQ15628 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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