Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A1Q14973 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms