Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNB1Q14721 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNB1Q14721 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms