Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BECN1Q14457 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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