Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A2Q14055 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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