Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK13Q14004 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
CDK13Q14004 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
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