Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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NCOA4Q13772 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCOA4Q13772 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
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NCOA4Q13772 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA4Q13772 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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