Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTCH1Q13635 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTCH1Q13635 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
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