Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PICALMQ13492 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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