Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
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