Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms