Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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