Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIN2BQ13224 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN2BQ13224 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN2BQ13224 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
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