Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPRL3Q12980 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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NPRL3Q12980 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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NPRL3Q12980 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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NPRL3Q12980 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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NPRL3Q12980 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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NPRL3Q12980 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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NPRL3Q12980 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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