Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
GRIN2AQ12879 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GRIN2AQ12879 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2AQ12879 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms