Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TROQ12816 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TROQ12816 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TROQ12816 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TROQ12816 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TROQ12816 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TROQ12816 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TROQ12816 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TROQ12816 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TROQ12816 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TROQ12816 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TROQ12816 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TROQ12816 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TROQ12816 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TROQ12816 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TROQ12816 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TROQ12816 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TROQ12816 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TROQ12816 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TROQ12816 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TROQ12816 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TROQ12816 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TROQ12816 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
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