Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CGNL1Q0VF96 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms