Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM27E3Q08E93 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms