Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN5Q08AF3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN5Q08AF3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms