Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms