Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LTBQ06643 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LTBQ06643 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LTBQ06643 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LTBQ06643 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms