Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP27A1Q02318 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP27A1Q02318 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms