Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNB1P62873 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNB1P62873 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNB1P62873 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms