Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BACE1P56817 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BACE1P56817 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BACE1P56817 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BACE1P56817 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BACE1P56817 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BACE1P56817 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BACE1P56817 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BACE1P56817 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BACE1P56817 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms