Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA1P56159 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms