Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB28P51157 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB28P51157 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB28P51157 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB28P51157 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB28P51157 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB28P51157 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB28P51157 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB28P51157 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB28P51157 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB28P51157 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB28P51157 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms