Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA2P47869 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms