Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCAMP43121 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCAMP43121 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCAMP43121 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCAMP43121 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCAMP43121 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCAMP43121 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
MCAMP43121 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCAMP43121 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms