Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP8P40818 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP8P40818 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP8P40818 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP8P40818 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP8P40818 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP8P40818 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP8P40818 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP8P40818 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP8P40818 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP8P40818 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP8P40818 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP8P40818 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP8P40818 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP8P40818 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP8P40818 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP8P40818 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP8P40818 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP8P40818 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP8P40818 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP8P40818 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP8P40818 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP8P40818 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms