Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LTBRP36941 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LTBRP36941 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LTBRP36941 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBRP36941 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBRP36941 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBRP36941 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBRP36941 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBRP36941 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBRP36941 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBRP36941 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBRP36941 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBRP36941 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBRP36941 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBRP36941 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBRP36941 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBRP36941 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBRP36941 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBRP36941 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBRP36941 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBRP36941 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms