Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CASQ1P31415 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CASQ1P31415 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CASQ1P31415 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CASQ1P31415 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CASQ1P31415 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CASQ1P31415 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CASQ1P31415 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CASQ1P31415 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CASQ1P31415 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CASQ1P31415 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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