Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPIFP30405 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms