Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLD1P28340 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLD1P28340 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLD1P28340 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLD1P28340 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLD1P28340 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLD1P28340 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLD1P28340 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLD1P28340 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLD1P28340 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLD1P28340 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLD1P28340 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLD1P28340 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLD1P28340 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLD1P28340 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLD1P28340 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLD1P28340 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POLD1P28340 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLD1P28340 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLD1P28340 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLD1P28340 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLD1P28340 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLD1P28340 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLD1P28340 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLD1P28340 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLD1P28340 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLD1P28340 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLD1P28340 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLD1P28340 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLD1P28340 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLD1P28340 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLD1P28340 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POLD1P28340 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POLD1P28340 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLD1P28340 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLD1P28340 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms