Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX1P22670 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX1P22670 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX1P22670 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX1P22670 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms