Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NF1P21359 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NF1P21359 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NF1P21359 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NF1P21359 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NF1P21359 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NF1P21359 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NF1P21359 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NF1P21359 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NF1P21359 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NF1P21359 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NF1P21359 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NF1P21359 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NF1P21359 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NF1P21359 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NF1P21359 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NF1P21359 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms