Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms