Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms