Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPI1P17947 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPI1P17947 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SPI1P17947 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPI1P17947 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPI1P17947 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPI1P17947 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPI1P17947 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPI1P17947 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPI1P17947 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPI1P17947 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPI1P17947 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPI1P17947 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPI1P17947 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPI1P17947 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms