Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD1P17405 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms