Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFAP15692 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms