Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM27P14373 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms