Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFTRP13569 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFTRP13569 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFTRP13569 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFTRP13569 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFTRP13569 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFTRP13569 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFTRP13569 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFTRP13569 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFTRP13569 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFTRP13569 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFTRP13569 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFTRP13569 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFTRP13569 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFTRP13569 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFTRP13569 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFTRP13569 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CFTRP13569 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CFTRP13569 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CFTRP13569 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CFTRP13569 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CFTRP13569 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CFTRP13569 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFTRP13569 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CFTRP13569 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFTRP13569 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CFTRP13569 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFTRP13569 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFTRP13569 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFTRP13569 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFTRP13569 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CFTRP13569 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFTRP13569 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CFTRP13569 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CFTRP13569 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFTRP13569 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFTRP13569 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFTRP13569 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFTRP13569 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CFTRP13569 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CFTRP13569 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFTRP13569 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFTRP13569 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CFTRP13569 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFTRP13569 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFTRP13569 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFTRP13569 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CFTRP13569 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CFTRP13569 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CFTRP13569 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
CFTRP13569 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CFTRP13569 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CFTRP13569 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CFTRP13569 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
CFTRP13569 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CFTRP13569 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms