Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDH1P12830 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDH1P12830 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH1P12830 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH1P12830 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms